Nationalt Genom Center søger en pipeline udvikler med fokus på kvalitetskontrol til WGS center i Aarhus

Denne stilling er desværre ikke længere ledig.
Se alle ledige stillinger

Århus N

Har du lyst til at være en del af et slagkraftigt team, der skubber grænser i en dynamisk atmosfære med de seneste teknologier, og hvor potentialet for udvikling er ligeså stort som din fantasi? Hos Nationalt Genom Center (NGC) har vi etableret en verdensklasse national infrastruktur til High Performance Computing (HPC), helgenomsekventering (WGS) og services for personlig medicin. Du vil blive en del af et tværfagligt team af eksperter, der er de bedste inden for deres respektive felter.

Om Nationalt Genom Center
Vi er en styrelse under Sundhedsministeriet, som har ansvar for at drive og udvikle en sikker national infrastruktur i sundhedsvæsenet, og understøtte at læger og forskere kan udvikle målrettet behandling ved hjælp af viden om patienters gener og ny teknologi.

Du kan finde mere information om os på vores hjemmeside www.ngc.dk.

Din hverdag hos os
Vi søger en pipeline udvikler til vores udviklingsteam. Du vil blive en del af et allerede eksisterende team af dedikerede eksperter, der arbejder på implementeringen af de nyeste bioinformatiske pipelines inden for databehandlingen af data fra helgenomsekventering (WGS).

Dine primære arbejdsopgaver vil være inden for kommunikation samt evaluering af resultater. Herudover skal du sørge for vedligeholdelse, opdatering og udviklingen af redskaber til kvalitetskontrol af den genererede data fra bioinformatiske pipelines. Dit arbejde og din ekspertise vil hjælpe med implementeringen af personlig medicin på et nationalt niveau.

Dit ansvarsområde vil omhandle design, udvikling samt implementering af back-end pipelines til at processere sekvensdata, i samarbejde med relevante interne og eksterne aktører.

Din uddannelse og erfaring:
Du har en akademisk uddannelse i bioinformatik, datalogi eller tilsvarende

Derudover lægger vi vægt på, at du har erfaring med:

  • Python, Workflow language (f.eks WDL eller Snakemake)
  • Rstudio, Jupyter eller andet statistisk analyse værktøj
  • CentOS på en supercomputer (HPC) ved brug af et PBS køsystem
  • effektivt samarbejde ved brug af Git-versionskontrolsystemet
  • at analysere store mængder af sekventerede data, hovedsageligt Illumina-baserede

Desuden lægger vi vægt på, at du har du gode engelskkundskaber samt kendskab til moderne softwareudviklingsprocesser samt projektbaseret udvikling.

Det vil være en fordel, hvis du har:

  • erfaring med at arbejde med databaser
  • kendskab til Illumina-sekventeringsteknologi
  • forståelse af wet-lab procedurerne inden for sekventering
  • erfaring med kodegennemgang
  • erfaring med testdreven udvikling samt CI/CD
  • erfaring med installation af software (f.eks. Docker eller Singularity)
  • gode danskkundskaber.

Personlige kvalifikationer
Vores ideelle kandidat:

  • Er dygtig og stolt af sit fagområde samt det ansvar, der følger med i at sikre den bedste datakvalitet til patientbehandling.
  • Har interesse for human helgenomsekventering, og som følger med i udviklingen af denne og tager initiativ i forbindelse med at afprøve nye tiltag inden for feltet i NGC.
  • Er dygtig til at kommunikere, formidle og modtage feedback fra folk med forskellige faglige baggrunde.
  • Er fleksibel og i stand til at arbejde selvstændigt, men er samtidigt dygtig til at samarbejde i og på tværs af teams.

Vi tilbyder
Vi tilbyder et interessant og udfordrende job i en international atmosfære med fokus på patienten, forskning, innovation og klinisk rådgivning til fordel for det omkringliggende samfund. Vi lægger vægt på et højt niveau af professionalisme iblandt vores ansatte, herved er udviklingen af færdigheder en integreret del af vores organisation. Vi tilbyder høj fleksibilitet i stillingen.

Stillingen er placeret i vores WGS-centers faciliteter i Aarhus (MOMA), Palle Juul-Jensens Boulevard 99, 8200 Aarhus N. Der må påregnes to til fire rejsedage om måneden til vores hovedkontor i København.

Om ansættelsen
Afhængig af din uddannelsesmæssige baggrund ansættes du enten efter:

  • Gældende overenskomst mellem Finansministeriet og Akademikernes Centralorganisation. Afhængig af dine kvalifikationer vil ansættelsen ske som enten akademisk medarbejder eller som special- eller chefkonsulent jf. overenskomstens bilag 4 om protokollat om special- og chefkonsulenter.

Eller

  • Gældende fællesoverenskomst mellem Finansministeriet og Offentligt Ansattes Organisationer (OAO-S-fællesoverenskomsten) og den til enhver tid gældende organisationsaftale mellem Finansministeriet og HK/Stat for kontorfunktionærer, laboranter og it-medarbejdere (HK), jf. aftalens bestemmelser vedrørende it-medarbejdere.

Det er en forudsætning for ansættelsen, at du kommer igennem PETs godkendelsesprocedure med henblik på sikkerhedsgodkendelse.

Kontakt os gerne
Ønsker du yderligere oplysninger om stillingen, er du velkommen til at kontakte specialkonsulent Piotr Starnawski på tlf. +45 2182 9254 eller enhedschef Ole Lund på tlf. +45 2130 7564.

Er du interesseret?
Klik på "søg stillingen" og send os din ansøgning med CV og eksamensbevis.

Samtaler forventes afholdt i uge 22, og eventuelle 2. samtaler forventes afholdt i uge 23.

Kilde: Jobnet.dk


Information og data

Denne ledige stilling har jobtypen "Akademisk medarbejder", og befinder sig i kategorien "Økonomi og jura".

Arbejdsstedet er beliggende i Århus N.

Jobbet er oprettet på vores service den 4.5.2021, men kan have været deaktiveret og genaktiveret igen.

Dagligt opdateret: Dette job opdateres dagligt ud fra jobudbyderens hjemmeside via vores søgemaskineteknologi og er aktivt lige nu.
  • Akademisk medarbejder
  • Århus N
  • Søndag den 30. maj 2021

Lignende jobs

Statistik over udbudte jobs som akademiske medarbejdere i Århus N

Herunder ser du udviklingen i udbudte akademisk medarbejder i Århus N over tid. Bemærk at jobs der ikke har en bestemt geografi ikke er medtaget i tabellen. I den første kolonne ser du datoen. I den næste kolonne ser du det samlede antal akademiske medarbejdere.

Se flere statistikker her:
Statistik over udbudte akademiske medarbejdere i Århus N over tid

Dato Alle jobs som akademiske medarbejdere
3. november 2024 5
2. november 2024 5
1. november 2024 5
31. oktober 2024 5
30. oktober 2024 5
29. oktober 2024 5
28. oktober 2024 6
27. oktober 2024 6
26. oktober 2024 6
25. oktober 2024 6
24. oktober 2024 6
23. oktober 2024 8
22. oktober 2024 8
21. oktober 2024 8
20. oktober 2024 9
19. oktober 2024 10
18. oktober 2024 12
17. oktober 2024 12
16. oktober 2024 10
15. oktober 2024 9
14. oktober 2024 10
13. oktober 2024 11
12. oktober 2024 11
11. oktober 2024 8
10. oktober 2024 7
9. oktober 2024 6
8. oktober 2024 6
7. oktober 2024 6
6. oktober 2024 6
5. oktober 2024 6
4. oktober 2024 4