Data scientist / bioinformatiker til udvikling af long-read genomsekventering til patientdiagnostik ved Klinisk Genet...

Denne stilling er desværre ikke længere ledig.
Se alle ledige stillinger

Odense C

Vil du være med til at udvikle morgendagens diagnostiske tilbud og gøre en forskel for patienter med genetiske sygdomme ved hjælp af tidens mest avancerede teknologier?

I forbindelse med implementering af long-read sekventeringsteknologi i vores diagnostiske laboratorie søger Klinisk Genetisk Afdeling, OUH, en data scientist / bioinformatiker. Der er i første omgang tale om en et-årig stilling til besættelse pr. 1. november 2021 eller snarest muligt herefter, evt. med mulighed for forlængelse.

Long-read sekventering er en gruppe af nye sekventeringsteknologier med stort potentiale inden for molekylærgenetisk patientdiagnostik. Du vil indgå i vores long-read team, hvor du sammen med afdelingens bioinformatikere og molekylærbiologer vil fokusere på udvikling og implementering af Nanopore long-read genomsekventering til patientdiagnostik.

Afdelingen varetager klassiske funktioner inden for specialet klinisk genetik, dvs. genetisk rådgivning og udførelse af en bred vifte af genetiske analyser i klinisk regi. Det drejer sig om både præ- og postnatale analyser, herunder bl.a. kromosomanalyser, FISH-analyser, kromosom mikroarrayanalyser, enkeltgens- og panelundersøgelser, NIPT (Non-Invasiv Prænatal Testning) samt exom- og genomsekventeringer. Laboratoriet foretager mere end 6500 analyser om året.

Afdelingen har ca. 3000 rådgivningsforløb pr. år. og deltager aktivt i tværgående klinisk samarbejde om udredning og rådgivning.

Til afdelingen er knyttet forskningsenheden Klinisk Genetik under Klinisk Institut, SDU. Forskningsenheden er meget aktiv og er fysisk placeret på afdelingen.

Dine opgaver bliver som udgangspunkt

  • Udvikle bioinformatiske pipelines og data-flows til analyse og tolkning af Nanopore long-read sekventeringdata.
  • Test og benchmark af relevante software og tools.
  • Udvikle løsninger til datavisualisering og rapportgenerering til kliniske fortolkere.
  • Data management.

Vi forventer, at du

  • Er cand.scient., cand.polyt. eller har lignende akademisk uddannelse med bioinformatisk viden.
  • Er vant til at håndtere store mængder data.
  • Er helheds- og udviklingsorienteret, omhyggelig og kvalitetsbevidst.
  • Har gode samarbejdsevner.

Vi ser desuden gerne, at du

  • Har erfaringer med sekventeringsdata, gerne Nanopore data.
  • Har erfaring med pipeline udvikling i Linux-/HPC-miljøer.
  • Erfaring med enten Python eller R vil være en fordel, samt Git og Docker.

Vi tilbyder

  • Et job med mulighed for personlig og faglig udvikling i et godt akademisk miljø.
  • Et job med stor frihed og medindflydelse.
  • Et job i en afdeling med et stærkt forskningsmiljø, som er i tæt tilknytning til SDU.
  • Et alsidigt job, hvor du har mulighed for at præge afdelingens kultur og udvikling.
  • Mulighed for deltagelse i relevante kurser og efteruddannelse.
  • Tæt tværfagligt samarbejde med afdelingens øvrige engagerede personale.
  • Et godt arbejdsmiljø med respekt for den enkelte.


Hvis du har spørgsmål
Kan du henvende dig til bioinformatiker Martin Larsen, tlf.: 6541 3468 / 2336 0862.

Løn og ansættelse
I henhold til overenskomst mellem Danske Regioner og relevant faglig organisation.

Kilde: Jobnet.dk


Information og data

Denne ledige stilling har jobtypen "Data Manager", og befinder sig i kategorien "Informationsteknologi".

Arbejdsstedet er beliggende i Odense C.

Jobbet er oprettet på vores service den 17.9.2021, men kan have været deaktiveret og genaktiveret igen.

Dagligt opdateret: Dette job opdateres dagligt ud fra jobudbyderens hjemmeside via vores søgemaskineteknologi og er aktivt lige nu.
  • Data Manager
  • Odense C
  • Mandag den 04. oktober 2021

Lignende jobs

Statistik over udbudte jobs som data managere i Odense C

Herunder ser du udviklingen i udbudte data manager i Odense C over tid. Bemærk at jobs der ikke har en bestemt geografi ikke er medtaget i tabellen. I den første kolonne ser du datoen. I den næste kolonne ser du det samlede antal data managere.

Se flere statistikker her:
Statistik over udbudte data managere i Odense C over tid

Dato Alle jobs som data managere
25. december 2024 0
24. december 2024 0
23. december 2024 0
22. december 2024 0
21. december 2024 0
20. december 2024 0
19. december 2024 0
18. december 2024 0
17. december 2024 0
16. december 2024 0
15. december 2024 0
14. december 2024 0
13. december 2024 0
12. december 2024 0
11. december 2024 0
10. december 2024 0
9. december 2024 0
8. december 2024 0
7. december 2024 0
6. december 2024 0
5. december 2024 0
4. december 2024 0
3. december 2024 0
2. december 2024 0
1. december 2024 0
30. november 2024 0
29. november 2024 0
28. november 2024 0
27. november 2024 0
26. november 2024 0
25. november 2024 0